隐藏任务，包括终将再起的涟漪、钟表把戏、坏孩子，好礼物、矛和盾，哐啷作声等，这些任务通常需要特定条件触发或在地图隐蔽位置寻觅完成。隐藏任务的奖励多为星琼、成就及独特道具，部分任务涉及复杂解谜或NPC互动，需玩家仔细留意环境细节和对话选项。

触发隐藏任务的首要条件是推进主线剧情至特定阶段，例如终将再起的涟漪需完成前置主线后，在场景中观察NPC对话变化或独特光影效果。寻觅经过中需注意地图未标注的角落，如黄金的时刻西北部校长室、折纸大学周边区域等位置常出现任务触发点。和场景中的可疑物品互动也也许获取线索，例如调查发光装置、破损书籍或独特标记，部分任务如钟表把戏需按特定顺序激活19个钟表装置。

NPC交互是隐藏任务的核心机制其中一个。无忧堂的信需在星槎海中枢调查黄色书籍并撰写回信；机巧鸟七宗罪则需和桥上机械鸟对话触发多阶段任务。部分任务标准反复和同一NPC对话累计好感度，或完成其公开的支线链，例如脏兮兮的零件任务需通过四次物品递交解开最终奖励。战斗类隐藏任务如银河球棒侠传说需配置特定人物组合，利用护盾和爆发技能应对精英怪机制。

梦境迷钟需破解黄金的时刻区域12处钟表谜题；三重权限则标准收集主控舱段的三重通行证。部分任务含时刻限制或隐藏计时机制，如F233星球关卡需在倒计时内完成地图寻觅和BOSS战。基础奖励通常为10星琼和2个残晶，而复杂任务如鲛人泪可获巡镝和信用点；全收集类任务如19个钟表把戏会解开唯一成就。部分隐藏任务存在多大结局分支，选择不同对话选项将影响奖励类型，例如碰瓷事件中选取高额信用点选项可获取额外资金。